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NGS是什麼?肺癌為何要基因檢測?找出HER2等罕見突變助精準治療

國人肺癌死亡率與發生率都冠居十大癌症之首,近年肺癌治療逐步走向精準醫療,除了癌症類型與分期影響治療策略,找出腫瘤突變基因如EGFR、ALK或HER2等,更可能影響治療預後成效。隨著可辨識的肺癌相關基因愈來愈多,基因檢測也從過去逐項檢查單一基因,發展到可一次分析多個基因的次世代基因定序(簡稱NGS)。

NGS是什麼?肺癌為何要基因檢測?找出HER2等罕見突變助精準治療

究竟NGS基因檢測是什麼?肺癌為什麼要做基因檢測?HER2除了發生於乳癌之外,也可能出現在肺癌嗎?《Hello醫師》專訪台北慈濟醫院研究部臨床試驗中心主任黃俊耀醫師,說明NGS與單基因、多基因檢測的差異,以及如何透過基因檢測找出HER2等較少見的驅動基因,協助醫師評估後續精準治療方向。

NGS基因檢測是什麼?和單基因、多基因檢測差在哪?

NGS(Next Generation Sequencing,次世代基因定序)是一種可同時分析大量基因變異的定序技術,目前常應用於癌症的多基因檢測,一次可分析數十至數百個癌症相關基因1;相較於一次僅針對特定基因進行分析的單基因檢測,NGS能取得範圍更廣的腫瘤基因資訊。

肺癌基因檢測之所以逐漸從單一基因走向多基因分析,與精準治療的發展有關。黃俊耀醫師說,醫界在2000年前後發現EGFR(表皮生長因子受體)基因突變後,醫師便開始依據患者是否帶有特定驅動基因,評估相對應的標靶治療;隨後ALK等驅動基因陸續被發現,肺癌治療也逐漸進入「先驗基因、再選藥物」的個人化時代。

隨著醫學研究進展,目前已知與肺癌相關的驅動基因除了EGFR、ALK之外,還包括ROS1、RET、MET、NTRK、BRAF、KRAS及HER2(ERBB2)等,需要掌握的基因資訊愈來愈多。若仍逐一進行單基因檢測,不僅耗時,且需反覆送驗,浪費檢體;因此,能一次分析多個基因的NGS便逐漸受到重視,並廣泛應用於癌症的多基因檢測。

基因檢測方式可簡單區分如下:

  • 單基因檢測:一次針對一個特定基因進行檢測,例如EGFR。
  • 多基因組合檢測(MGT):一次檢查多個事先選定的癌症相關基因,涵蓋範圍較單基因檢測廣。
  • NGS次世代基因定序:可進行多基因分析定序,一次檢測數十至數百個癌症相關基因;部分檢測除了驅動基因外,也能提供其他腫瘤相關分子資訊。

肺癌為何需做基因檢測?找出驅動基因評估治療方向

肺癌患者接受基因檢測,主要是為了確認腫瘤是否帶有具有治療意義的「驅動基因」;驅動基因是指可促使癌細胞形成、持續生長或增殖的特定基因變異2。不同患者可能帶有不同的驅動基因,因此同樣是肺癌患者,個別適合的治療方式也可能不同。

黃俊耀醫師說,精準治療的核心在於「知道病人身上有什麼驅動基因,再去開立治療藥物」;找出不同基因變異後,醫師才能進一步評估是否有相對應的標靶治療,並綜合疾病狀況與其他分子資訊規劃後續治療。

此外,一些過去被視為少見的驅動基因,也可能會因為檢測機會較少而未被完整發現。黃俊耀醫師依據自身的臨床經驗指出,若只聚焦常見基因,可能低估部分少見驅動基因的實際情況,「甚至可能造成病人部分前期治療成為無效醫療。」

除了找出可對應治療的驅動基因外,NGS也可能提供腫瘤突變負荷(TMB)等與腫瘤特性及預後相關的分子資訊。黃俊耀醫師強調,「NGS不只是單純找藥,也能幫助判斷病患存活機率有多高、協助臨床醫師擬定治療策略。」

肺癌接受NGS基因檢測的優點?避免耗時、檢體不足與檢測盲區

若肺癌患者需要檢測多個癌症相關基因,NGS與逐項單基因檢測的差異,主要可從等待時間、檢體使用與檢測範圍3個面向來看:

1.逐項檢測可能拉長等待時間

若採取單基因檢測,患者可能需先完成較常見的基因檢測;若結果為陰性,再陸續加驗其他基因,每次送驗與等待報告都需要時間。

黃俊耀醫師解釋,單基因檢測,從確診到陸續完成相關檢測與確認後續治療方向,整體等待時間可能拉長至約6週;相較之下,若檢體可直接送做NGS,約2週即可取得較完整的檢測結果。3他直言:「6個禮拜跟2個禮拜差很多,對病人和家屬來說,等待期間的焦慮感也截然不同。」

他也以GPS(Global Positioning System,全球定位系統)比喻,說明NGS的重要意義,「以前沒有GPS的年代,開到一個路口就要問一下怎麼走;NGS就像GPS的概念,就是一步到位,不要再浪費那麼多的時間。」

2.反覆檢測可能消耗有限的腫瘤檢體

肺癌的腫瘤組織檢體往往有限,若每次檢查不同基因都需使用部分檢體,逐項檢測下來,就可能面臨剩餘組織不足、甚至需重新取得檢體的問題。

黃俊耀醫師形容,若採單基因逐項檢測,「這邊測一個切一塊,第二個再切一塊」,會持續消耗有限的檢體;他特別強調:「Tissue is issue,組織檢體非常重要,要珍惜病人的組織。」NGS可透過一次送驗,同時分析較多癌症相關基因,可以更有效利用有限的腫瘤檢體。

3.檢測範圍有限,可能漏掉少見基因變異

若檢測只聚焦EGFR、ALK等較常見的基因,就可能無法一次掌握HER2等較少見的驅動基因。部分被認為發生率較低的驅動基因,可能與過去未被充分檢測有關;因此,檢測涵蓋的基因範圍愈廣,愈有機會掌握HER2等較少見的基因變異。

肺癌HER2基因突變是什麼? 

HER2又稱ERBB2,是與細胞生長訊號傳遞有關的基因之一4。黃俊耀醫師解釋,HER2屬於ERBB受體家族,其中ERBB1就是大家較熟悉的EGFR,ERBB2則是HER2;當這類基因出現異常時,可能持續傳遞促使腫瘤生長的訊號。

提到HER2,多數人第一時間想到的是乳癌,但HER2異常同樣也可能出現在肺癌。兩者雖然都與HER2有關,臨床上常見的檢測方式並不完全相同;乳癌較常透過組織染色評估HER2蛋白表現,肺癌則可透過NGS找出ERBB2(HER2)基因突變等異常。

黃俊耀醫師指出,國外研究曾觀察到,肺腺癌患者在治療前出現HER2相關變異的比例約為4%5;不過依他的臨床觀察,HER2在肺癌患者中可能比過去認知的更常見。

他說明:「其實不是沒有,可能只是我們沒驗到。」隨著NGS應用逐漸普及,醫師也有更多機會找出HER2等較少見的基因變異,進一步評估相對應的精準治療策略。

近年國際間針對HER2突變肺癌的治療持續發展,包括抗體藥物複合體(ADC)與新型標靶治療等方向。HER2過去在肺癌中較少受到關注,但隨著相關治療選擇逐漸增加,辨識HER2基因突變的臨床重要性也隨之提升;對肺癌患者而言,若能透過基因檢測及早找出HER2等較少見的基因變異,醫師便有更多資訊評估後續精準治療方向。

肺癌接受NGS基因檢測的時機:初診、晚期、抗藥復發一次看

肺癌是否需要接受NGS基因檢測,須依癌別、分期、已完成的基因檢測、檢體狀況與治療需求綜合評估。常見需要討論基因檢測的時機,包括初次確診、晚期或轉移性肺癌,以及治療後產生抗藥或疾病惡化時。

1.初次確診時:治療前先掌握腫瘤基因特徵

肺腺癌患者確診後,可及早與醫療團隊討論是否接受NGS基因檢測,在開始治療前先確認腫瘤是否帶有EGFR、ALK、HER2等驅動基因,再據此評估後續治療方向。

黃俊耀醫師認為,與其在尚未掌握腫瘤基因特徵的情況下,僅依過往經驗決定治療,更應在確診時就及早了解患者的基因狀況。他強調:「依據NCCN(National Comprehensive Cancer Network,美國國家綜合癌症網路)Guideline(臨床指引),一開始就該驗了。6」

2.晚期或轉移性肺癌:基因檢測有助規劃治療方向

對晚期或轉移性肺癌患者而言,治療選擇較仰賴腫瘤的分子特徵,因此確認是否帶有具有治療意義的驅動基因,有助醫師進一步評估標靶治療或其他治療策略。

3.治療抗藥或疾病惡化時:可能需再次基因檢測

即使患者在治療前已完成基因檢測,也不代表這份結果可以一直沿用。黃俊耀醫師說明,腫瘤在治療過程中可能持續產生新的基因變化,原本有效的治療一旦出現抗藥,便需要重新了解腫瘤目前的狀態。

以EGFR突變肺癌為例,患者接受標靶治療一段時間後若產生抗藥性,重新切片與基因檢測可能發現新的抗藥基因、其他驅動基因變化,甚至出現腫瘤型態改變;也就是說,治療前的基因檢測反映的是當時的腫瘤特徵;當疾病再次惡化時,原本的基因資訊未必還能完整代表腫瘤現在的狀態。

黃俊耀醫師常跟病患說:「你已經不是兩年前的你了,你的DNA也會變。」當治療出現抗藥或疾病進展時,可再與醫師討論是否需要重新取得檢體、再次進行NGS基因檢測,藉此掌握腫瘤最新的基因變化,評估下一步治療方向。

主動討論NGS基因檢測,共同規劃治療方向

最後,黃俊耀醫師也向確診肺癌或正在評估治療選擇的病友打氣,無論是肺腺癌、鱗狀上皮癌、小細胞肺癌或其他肺癌類型,現今有愈來愈多元的治療選擇;而在選擇治療方式之前,若能先掌握腫瘤的基因與分子特徵,也有助醫師精準評估治療方向。

對於HER2等較少見的基因變異而言,若只檢查少數常見基因,便可能無法掌握完整資訊。因此,病友在治療前可主動與醫療團隊討論是否需要進一步接受NGS基因檢測,充分了解檢測結果與不同治療選擇。

黃俊耀醫師也強調:「病人才是主導治療角色的最終決定者。」若對疾病狀況、檢測結果或治療方式仍有疑問,可以主動詢問醫師或尋求第二意見;他也鼓勵病友:「勇敢告訴醫師,我要活下去。」在掌握足夠資訊後,與醫療團隊共同規劃最適合自己的治療策略。

(圖片授權:Shutterstock)

medical
黃俊耀醫師
醫學審稿:
胸腔內科 · 台北慈濟醫院
文: Sara Gao · 更新日期:19 小時前